Trụ sở chính của CNC hiện đặt tại cơ sở I. Tổng diện tích quỹ đất của CNC hiện có là 17,2 ha.

Tại Bắc Ninh:

• Cơ sở I: E6 – Khu công nghiệp Quế Võ - TP.Bắc Ninh (2,1 ha).
• Cơ sở II: Thuộc Làng Đại học 2 - Huyện Tiên Du (15,1 ha). UBND tỉnh Bắc Ninh đã có văn bản đồng ý giao cho trường khu đất này để đầu tư, xây dựng và nâng cấp phát triển thành Trường Đại học Việt Nhật. Trường đang tiến hành khảo sát, đền bù giải tỏa cho dân và làm thủ tục đầu tư xây dựng.

Tại Hà Nội: 55 Mai Hắc Đế - Hai Bà Trưng - Hà Nội